Theo Bộ Tài chính, việc Petrolimex Aviation bán nhiên liệu cho hãng hàng không Việt Nam tại sân bay nước ngoài điểm giao - nhận hàng hóa ở ngoài Việt Nam thuộc đối tượng chịu thuế GTGT với thuế suất 0% nếu đáp ứng các điều kiện quy định tại khoản 2 Điều 9 Thông tư số 219/2013/TT-BTC hướng dẫn thi hành Luật Thuế GTGT và Nghị định số 209/2013/NĐ-CP quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Luật Thuế GTGT.
Hoạt động bán hàng này của Petrolimex Aviation thông qua việc ký kết hợp đồng mua nhiên liệu bay với các đối tác cung cấp tại sân bay nước ngoài và ký kết hợp đồng cung ứng nhiên liệu với các hãng hàng không Việt Nam.
Bộ Tài chính cũng hướng dẫn, căn cứ vào quy định pháp luật về thuế BVMT, xăng dầu do Petrolimex Aviation mua về để xuất khẩu thuộc đối tượng chịu thuế BVMT.
Trường hợp Petrolimex Aviation mua xăng dầu của Công ty Lọc hóa dầu Bình Sơn và đã khai, nộp thuế BVMT với cơ quan thuế nội địa để cung ứng cho phương tiện vận tải của hãng nước ngoài trên tuyến đường qua cảng Việt Nam, hoặc phương tiện vận tải của Việt Nam trên tuyến đường vận tải quốc tế, Petrolimex Aviation được hoàn thuế BVMT đã nộp tương ứng với lượng xăng dầu đã cung ứng.
Cơ quan thuế nội địa nơi Petrolimex Aviation đã khai và nộp thuế BVMT khi mua xăng dầu của Công ty Lọc hóa dầu Bình Sơn có trách nhiệm hoàn thuế BVMT cho Petrolimex Aviation tương ứng với lượng xăng dầu đã cung ứng.
