Sau khi trao đổi với VRA và các doanh nghiệp ngành cao su, Bộ NNPTNT đã có công văn số 9683/BNN-CB ngày 02/12/2014 gửi Bộ Tài chính đề nghị xem xét áp dụng chính sách thuế không phải kê khai, tính nộp thuế giá trị gia tăng ở khâu kinh doanh thương mại đối với các mặt hàng cao su thiên nhiên sơ chế.
Bộ NNPTNT cho biết theo Điều 8 Luật Thuế Giá trị Gia tăng, sản phẩm trồng trọt, chăn nuôi, thủy sản chưa qua chế biến và mủ cao su là những hàng hóa đều có chung mức thuế suất là 5%. Tuy nhiên, theo hướng dẫn của Tổng cục Thuế tại công văn số 7062/BTC-TCT ngày 29/5/2014, thì nhiều mặt hàng như cà phê, hạt điều, hạt tiêu, gạo, lúa, cám... là sản phẩm của trồng trọt chưa chế biến thành sản phẩm khác đều không phải kê khai, tính thuế ở khâu kinh doanh thương mại, nhờ vậy đã tạo thuận lợi giúp đẩy mạnh sản xuất, kinh doanh xuất khẩu các mặt hàng này.
Tuy nhiên, mặt hàng mủ cao su sơ chế cũng là sản phẩm của trồng trọt, chưa chế biến thành sản phẩm khác thì lại bị loại trừ ra, tạo ra môi trường kinh doanh không bình đẳng giữa các doanh nghiệp kinh doanh trong lĩnh vực nông sản và thủy hải sản.
Theo Bộ NNPTNT, nếu áp dụng chính sách thuế không phải kê khai, tính nộp thuế VAT ở khâu kinh doanh thương mại đối với các mặt hàng cao su thiên nhiên sơ chế, sẽ tạo điều kiện giúp doanh nghiệp xuất khẩu không phải ứng vốn trả thuế VTA đầu vào, ngăn chặn được nạn gian lận về hoàn thuế VAT, tiết kiệm được thời gian, nhân lực của cơ quan thuế.