Nguyên nhân của việc chênh lệch này được V21 đưa ra là do điều chỉnh giảm doanh thu một số công trình chưa đủ điều kiện ghi nhận, từ đó làm lợi nhuận trong kỳ giảm.
Bên cạnh đó, kiểm toán cũng đưa ra các ý kiến lưu ý như công ty chưa thực hiện trích lập dự phòng đối với các khoản phải thu quá hạn thanh toán theo quy định tại thông tư số 228/2009/TT-BTC ngày 7/12/2009 của Bộ Tài chính với số dự phòng ước tính là hơn 6,6 tỷ đồng.
Bên cạnh đó, công ty chưa thực hiện đầy đủ việc kê khai, nộp thuế GTGT và tạm nộp thuế TNDN liên quan đến khoản tiền ứng trước của khách hàng liên quan đến dự án Khu nhà ở Phú Thịnh theo quy định hiện hàng.
Tại thời điểm 30/6/2014, công ty không thực hiện kiểm kê giá trị sản lượng dở dang của các công trình nên một số công trình được Công ty liên kết chuyển giá vốn trên cơ sở ước tính.